在枫亭塔斗山麓，坐落着仙游“四大丛林”之一的会元寺，原名“东禅院”，又作“东林禅寺”。

　　相传会元寺始建于唐永徽、开元年间（650-741年），曾为仙游龙华寺的属院。明陈迁《仙溪志》记载：“龙华寺，县西南五里，唐垂拱二年（686 年）置……别为东禅等院十有一，深沙等庵七十有七……”，这说明在唐垂拱二年时东禅院已然存在。

　　会元寺虽历经唐末的兵燹之灾，但在五代时期得以重建。宋太平兴国三年（978 年），陈洪进“纳土归宋”后，会元寺与其女陈玑创建的泉州崇福寺有了紧密的联系。清林有融所著《枫亭志》与郑得来所著《连江里志略》均有记载：“全安庄在陡门，五代时陈洪进建……”；明陈迁《仙溪志》亦载：“东林佛刹，县南五十里。泉南崇福寺寄庄也，宋陈洪进、蒲寿庚舍田入寺，名其庄曰全安……”。同时，《仙溪志》还显示了其产钱情况，“东禅院曾产钱九贯一百三十三文”，而成为泉南崇福寺寄庄后，其寄庄产钱二十三贯一十四文，由此可见其当时地位之重要。

　　会元寺在漫长的历史长河中历经多次兴衰起伏。据史料记载，元大德元年（1297年），僧人祖和请求将盐埕改为田地，并开始在庄舍背面建造佛刹。至明成化丁未年（1487年），泉南的僧纲德兴又在旧址左侧重新建造，此时规模已颇为壮观，拥有月波阁、放生池、二笑亭、清风楼、倦飞馆等。明《仙溪志》详细记录了这些建筑及其题刻名称、内容：“……月波阁，泉南知府维杨马伯赡书。放生池，行人沙堤蔡元美书。二笑亭，兴化知府燕山岳正书。蓬莱，泉南布衣陈利夫书。倦飞馆，福建提学佥事金陵任彦常书。清风楼，泉南僧正叟书……”，它们各具文化内涵。陈迁亦对寺院赞赏有佳，留下诸多优美诗篇，让后人得以领略其独特魅力。如《题东林诗》云：“人皆爱城市，我独爱山林。看水胜看画，爱山不爱金。兴来行水曲，醉后步花阴。富贵非吾愿，伊谁契我心。”又云：“二月见春水，八月见秋山。悠悠山与水，长伴白云闲。夏来不觉暑，年尽不知寒。倚门看飞鸟，一笑海天宽。”“花开应为春，路湿非因雨。人引水上云，鸟落汀头树。传声空谷中，山川学人语。月出晚潮来，扁舟向南去。”“竹杖挂芦鞋，有意入山来。细咽松花饼，高枕白云堆。有酒莫尽醉，且沃花尽开。看花兼对酒，不上雨花台。”诗中尽显对自然的赞美以及对世俗富贵的淡薄，那悠悠的山水，仿佛与白云长久相伴，给人无尽遐想。

　　历经岁月的洗礼，会元寺几经更名，最终在清咸丰九年（1859年），心宽和尚重建寺院并取名为“会元寺”。据寺内《光绪年功德碑》载：“清，从来天绥有德，佛化有缘，功德兴起，子孙炽昌。自咸丰九年间，心宽大师起盖会元寺，则建功立业，功德无量。其后，惠邑大路乡法元堂道友常觉、普好兄弟同心协力，建置田园陆亩五分。后之善男信女，当积腋成裘，克振基业，不可损坏。缅耕耘之有资，号千年不朽；立斯文于石上，号万古长存。光绪岁次庚子年（1900年），主持德永重兴大殿。光绪癸巳年（1893年）二月日立”。寺内一块落款为“宣统二年（1910 年）九秋之吉，重兴本刹住持德永敬立”的“金仙”匾额与民国宋慎杰所著《枫亭志续编》中记载“斗山上建会心书院，祀文昌……山半有会元寺，佛殿庄严，楼宇高敞……”，共同见证了会元寺的历史变迁。

　　会元寺还留存着众多具有考古价值的历史文物，如石珠、海会塔等。海会塔上的众多石刻：“万泒潮源”“海天佛国”“风松”“水月”等，落款多为清末民初著名国画家林肇祺所题。据郑义《林肇祺画集》记载“林肇祺（1868-1930），枫亭镇学士人，字介人，号颐道人、寿庵氏、鹤也、蓝鹿樵者、摘斗山民、鹤野老人、锦麓樵人、守瓶道者，后又号半痴、巨痴、跛鹤、跛道人，光绪年间随营厦门协镇李祥麟衙署，为捕厅，得授军功六品衔……为闽派主要代表画家之一”。此外，寺内还有其他文物，如一块墓碑刻“塔斗山，会元寺住持之塔，光绪己未（1895 年）葭月谷旦，住山微嘉建立”；一对楹板刻：“觉皇御宇庄严 左暮鼓右晨钟 醒却容尘痴梦想，性海涌空浩淼 渡慈航登彼岸 证来佛国乐逍遥。”落款“光绪岁次壬寅（1902年）嘉平之吉，斗山监院丹固敬题。丹固。一尘补霆（处）”；以及一块“慈化流芳”落款“会元祖庭重建落成志庆，清量（应为董事的‘董’字）……仝敬贺”等。

　　清乾隆《仙游县志·书院》记载的古代六个书院之一会心书院，如今在塔斗山已不知何处，但现会元寺内尚存“会心书院”遗址，以此纪念。县志载：“会心书院：在连江里塔斗山，旧为庵。嘉靖元年，知县萧宏鲁以淫祠撤之。四年（1525年），知府朱衮倡建书院，冠以今名……万历四十二年（1614年），知县徐观复修，后因筑寨备寇，寨破祠圮。国朝康熙间，侯书募修”。清郑德来手集《摘斗山古迹备记》又云：“正德间，本府太守岳公，讳正，号三洲，来游于此，捐俸重修书院，匾额于山门曰：会心书院。至嘉靖壬戌（1562年）间被倭寇毁折，平倭都督戚公，讳继光，号南塘，捐俸倡，本里庠士薛缙等重建祠宇，遂改名摘斗山。”又，明抗倭英雄戚继光《登摘斗岩》诗云：“幽径层层草树遮，山亭高望隔烟霞。扳跻到处同回首，万户千门总一家”。

　　会元寺承载着深厚的历史文化底蕴，历经沧桑而闪耀着独特的光芒。如今的会元寺自山门而入，依山而建，雄伟壮观，正所谓“高空殿宇峰腰寺，云里钟声月里人”。无论是曾经作为“龙华寺的附属”，还是“泉南崇福寺的寄庄”，又或是历经多次更名，它始终是仙游古代宗教文化的瑰宝，其存在便是仙游宗教文化的重要见证。