花的颜色不同主要是因为花瓣内所含化合物的成分（色素）不同。这些化合物大致可以分为花青素和胡萝卜素。花青素极不稳定，遇酸呈红色，遇碱呈蓝色，中性呈紫色，酸碱性的强弱还会直接影响色彩的深浅。胡萝卜素能够使花呈现出黄、橙、红等色彩，而胡萝卜素种类繁多，目前已知共有80多种。
    自然界中绿色的花比较少见，这是因为形成绿色的色素主要是叶绿素，它一般存在于植物的茎叶组织中，而花瓣中很少，但是绿色的花还是存在的。例如绣球花，它的花多呈球形白色，到后期会变成蓝绿色或粉红色。一种中国原生的蔷薇，其花大而呈绿色，是月季的变种。还有如稻、粟、葱等非观赏性植物也有很多品种的花是绿色的。当然，随着技术的发展，人类也在利用基因、染色等方法人工制造出绿色的花卉，如绿玫瑰。